FMO計算法：入門から創薬への応用まで
ハンズオン講習会 --『FOCUSスパコンでのFMO計算の実際』と『”たんぱく質-小分子リガンド”複合体のFMO計算のコツ』--
フラグメント分子軌道法（FMO法）では、量子力学に基づいたタンパク質-リガンド間の相互作用エネルギーが求められるため、構造ベース創薬のための「古典力場では得られない重要な情報」が提供されます。
今回の講習会では、1日目に初心者向けにABINIT-MPとBioStation Viewerを用いたFMO計算の実際を体験します。2日目には”タンパク質‐小分子リガンド”複合体におけるFMO計算に関して、つまずきやすい点を取り上げ解決策を解説します。両日とも講義と演習で学ぶ実践的な内容となってます。
なお実習では「FOCUSスパコン」を用いるため、FOCUSスパコンの概要に関する講義も含まれます。
| 日程 | 2018年2月1日（木）、2月2日（金） 両日 10：00～17：00（受付開始 9：45～） |
|---|---|
| 場所 | 公益財団法人計算科学振興財団（FOCUS) 実習室【アクセス】 神戸市中央区港島南町7-1-28 計算科学センタービル ポートライナー「京コンピュータ前」駅より徒歩3分 |
| 対象者 | 主として次のような方を対象とします。 1）”タンパク質‐小分子リガンド”複合体のFMO計算に興味をお持ちの方 2）FMO法に興味はあるが、これまでほとんど経験のない方 3）ABINIT-MPとBioStation ViewerによるFMO計算に興味のある方 4）ABINIT-MPのインストール手順について知りたい方 5）FMO計算における基底の選び方や、計算がエラーで中途終了した際の対応に不安のある方 6）リガンドのフラグメント分割について詳しく知りたい方 |
| 内容 | 1日目午前：Linux mini講習会（初心者向） 1日目午後：理論（入門編）、ABINIT-MPとBioStation Viewerを用いたFMO計算の実際（初心者向）、ABINIT-MPのインストール方法 2日目午前：FOCUSスパコン概要、FMO計算のベンチマーク結果と効率的な流し方 2日目午後：理論（中級編）、FMO計算のトラブルシューティング、手動フラグメント分割（中級者向） |
| 受講料 | 無料（定員10名） |
| 申込方法 | 下の申込フォームよりお申込みください。部分的な参加も歓迎します。「質問等」欄に専門分野（計算科学、創薬・合成化学、構造生物学、その他該当する分野全て）を明記のこと。 【締切】１月31日（水） なお、開催にあたって、参加者情報は講演者に提供されます。 |
