FMO計算法:入門から創薬への応用まで
ハンズオン講習会 --『FOCUSスパコンでのFMO計算の実際』と『”たんぱく質-小分子リガンド”複合体のFMO計算のコツ』--
フラグメント分子軌道法(FMO法)では、量子力学に基づいたタンパク質-リガンド間の相互作用エネルギーが求められるため、構造ベース創薬のための「古典力場では得られない重要な情報」が提供されます。
今回の講習会では、1日目に初心者向けにABINIT-MPとBioStation Viewerを用いたFMO計算の実際を体験します。2日目には”タンパク質‐小分子リガンド”複合体におけるFMO計算に関して、つまずきやすい点を取り上げ解決策を解説します。両日とも講義と実習で学ぶ実践的な内容となってます。
なお実習では「FOCUSスパコン」を用いるため、FOCUSスパコンの概要に関する講義も含まれます。
日程 | 2018年8月9日(木)、8月10日(金) 両日 10:00~17:00(受付開始 9:45~) 両日とも午後の部は12:30からの開始となります。 |
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場所 | 公益財団法人計算科学振興財団(FOCUS) 実習室【アクセス】 神戸市中央区港島南町7-1-28 計算科学センタービル ポートライナー「京コンピュータ前駅」より徒歩3分 |
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対象者 | 主として次のような方を対象とします。 1)”タンパク質‐小分子リガンド”複合体のFMO計算に興味をお持ちの方 2)FMO法に興味はあるが、これまでほとんど経験のない方 3)ABINIT-MPとBioStation ViewerによるFMO計算に興味のある方 4)ABINIT-MPのインストール手順について知りたい方 5)FMO計算における基底の選び方や、計算がエラーで中途終了した際の対応に不安のある方 6)リガンドのフラグメント分割について詳しく知りたい方 |
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内容 |
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受講料 | 無料(定員10名) | ||||||||
申込方法 | 下の申込フォームよりお申込みください。部分的な参加も歓迎します。「質問等」欄に専門分野(計算科学、創薬・合成化学、構造生物学、その他該当する分野全て)を明記のこと。 【締切】8月8日(水) なお、開催にあたって、参加者情報は講演者に提供されます。 |
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主催等 | 主催:神戸大学計算科学教育センター 共催:CBI学会FMO研究会 協賛:(公財)計算科学振興財団 後援: ㈱モルシス、㈱富士通九州システムズ |
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